קבוצת המחקר של נעם שנטל נמצאת בתפר שבין מדעי המחשב וביולוגיה, תוך נסיון לפתור בעיות בביולוגיה תוך שימוש בכלים חישוביים, דוגמת למידה חישובית ושיטות אופטימיזציה. בקבוצה שני כיווני מחקר עיקריים: האחד הוא פיתוח שיטות group testing לפתרון בעיות בביולוגיה וברפואה, והשני הוא פיתוח שיטות חישוביות לחקר המיקרוביום. כלל הפרויקטים נעשים תוך שיתוף פעולה הדוק עם ביולוגים ניסיוניים, אשר מאפשר הגדרה מדויקת של כלים חישוביים אשר מאידך תורמים למחקר הביולוגי.
בשנת 2020 בתחילת מגפת הקורונה יזם פרופ' שנטל מחקר המיישם שיטות group testing לצורך הגדלת מספר הבדיקות לגילוי הנגיף. שיטה זו, אשר פותחה בשיתוף פרופ' תומר הרץ ופרופ' אנג'ל פורגדור מאוניברסיטת בן-גוריון, אומצה ע"י משרד הבריאות ומשמשת לבדיקות קליניות בישראל.
דוגמה נוספת למחקר אשר משלב בין ביולוגיה לבין מדעי המחשב, הינו שיתוף פעולה עם פרופ' רביד שטראוסמן ממכון ויצמן למדע בנושא חיידקים הנמצאים בתוך גידולים סרטניים. בעבודה רחבת היקף אנו מראים לראשונה שחיידקים נמצאים במגוון גידולים סרטניים ומספקים הבנה ראשונית לגבי פעולתם. לדוגמה, אנו מוצאים שחיידקים אשר נמצאים בגידולים בריאות של מעשנים נוטים לפרק תוצרי סיגריות, לעומת חיידקים אשר נמצאים בגידולים דומים באנשים שאינם מעשנים. מחקר זה חייב, בתור דרישת קדם, פיתוח של שיטות חישוביות אשר מתגברות על מספר קשיים טכנולוגיים וביולוגיים בלעדיהם מחקר שכזה אינו אפשרי.
פרופ' נעם שנטל מתארח במעבדתו של פרופ' איתן דומאני מהמחלקה לפיזיקה של מערכות מורכבות, מכון ויצמן למדע.
ליצירת קשר: [email protected]